MediosOn, la Asociación Española de Medios de Comunicación Online, tiene dos órganos de gobierno: la Asamblea General de Asociados en la que están representadas todas las compañías asociadas y la Junta Directiva, el órgano permanente que dirige la asociación.

La actual Junta Directiva de MediosOn fue elegida en la Asamblea General de Asociados celebrada en Madrid a finales del mes de enero de 2011. Se compone de 10 representantes: 1 presidente, 2 vicepresidentes y 6 vocales, todos ellos con derecho a voto. Se completa la Junta con la figura del Director General que tiene voz, pero no voto en ninguno de los órganos de gobierno de la asociación.

Composición de la Junta Directiva de MediosOn (2011-2013)

Está presidida por Juan Luis Moreno del Grupo Vocento.
Las dos vicepresidencias las ocupan Rosalía Lloret de Unidad Editorial; y Francisco Sierra del Grupo Antena 3.
Los seis puestos de vocales están representados por José Luis Rodríguez, Grupo Godó; Ángel Angulo, Editorial Prensa Ibérica; ; José Cerezo, Prisa Digital; Rubén Pamplona, Zeta Digital; Sandra Prósperi, Hachette Filipacchi; Alfredo Peña, La Sexta.

Juanjo Amorín completa la Junta ocupando el puesto de Director General.

Además de la Asamblea General de Asociados y de la Junta Directiva, MediosOn tiene 5 comités especializados que trabajan impulsando iniciativas de nuevos proyectos de la asociación y dando seguimiento a las evoluciones y decisiones del mercado que pueda afectar a los medios de comunicación online. Estos son los comités de trabajo: Audiencias. Innovación. Nuevos ingresos. Legal. Audiovisual.